酸奶虽好，但并不是所有人都适合食用。腹泻或其他肠道疾病患者在肠道损伤后喝酸奶时要谨慎;1岁以下的小宝宝，也不宜喝酸奶。此外，糖尿病人、动脉粥样硬化病人、胆囊炎和胰腺炎患者好别喝含糖的全脂酸奶，否则容易加重病情。
喝酸奶要注意适可而止，否则很容易导致胃酸过多，影响胃黏膜及消化酶的分泌，降低食欲，破坏人体内的电解质平衡。尤其是平时就胃酸过多、常常觉得脾胃虚寒、腹胀者，更不宜多饮。
　酸奶确实有一定的减肥效果，主要是因为它含有大量活性乳酸菌，能够有效地调节体内菌群平衡，促进胃肠蠕动，从而缓解便秘。而长期便秘和体重增加有一定的关系。而且酸奶还具有一定的饱腹感，轻微饥饿时喝一杯可以有效缓解迫切的食欲，从而减少下一餐的进餐量。但是不要忘记，酸奶本身也是含有一定热量的，其热量要比牛奶高一些，如果在原有膳食基础上额外多吃，同样会引起体重增加。
　　如今，不仅酸奶的品种琳琅满目，而且酸奶饮料也层出不穷，你很有可能把不是酸奶的“酸奶”买回了家。酸奶是由优质的牛奶经过乳酸菌发酵而成的，本质上属于牛奶的范畴；而酸奶饮料，只是饮料的一种，不再是牛奶。二者的营养成分含量差别很大，酸奶饮料的营养只有酸奶的1/3左右。按照乳品行业的规定，100克的酸奶要求蛋白质的含量≥2.9克，而酸奶饮料的蛋白质含量却只有1克左右。
　　很多人都认为牛奶经过发酵变成酸奶后会更有营养，事实上从营养价值来说，两者差异不是很大。不过，酸奶与牛奶相比，酸奶更易于消化和吸收，使得它的营养素的利用率有所提高。此外，牛奶中所含的糖分大部分是乳糖，有部分成人的消化液中缺乏乳糖酶，影响了对乳糖的消化、吸收和利用，造成这些人喝牛奶后胃部不适甚至腹泻，称为“乳糖不耐受症”，此时可以用酸奶来代替牛奶。
　　当你饥肠辘辘时，常常会马上抓起一杯酸奶，一饮而尽?!这样确实能够缓解一下饥饿的感觉，但是好别拿酸奶充饥。因为空腹时胃内的酸度大(pH值是2)，酸奶所特有的乳酸菌易被胃酸杀死，其保健作用会大大减弱。还是在饭后l～2小时的时候再喝吧!因为这时胃液被稀释，胃内的酸碱度适合乳酸菌生长。另外，在晚上喝酸奶好处也更多一些。
 
　　　酸奶和很多食物搭配起来都很不错，特别是早餐配着面包、点心，有干有稀，口感好还营养丰富。但千万不要和香肠、腊肉等高油脂的加工肉品一起食用。因为加工肉品内添加了硝，也就是亚硝酸，会和酸奶中的胺形成亚硝胺，是致癌物。酸奶还不宜和某些药物同服，如氯霉素、红霉素等抗生素、磺胺类药物等，它们可杀死或破坏酸奶中的乳酸菌。
　　很多资料上都说酸奶不能加热喝，怕加热后酸奶中有价值的乳酸菌被杀死，而且口味和口感都会改变，其营养价值和保健功能也会降低。但若只把酸奶加热到微温，酸奶中的乳酸菌就不会被杀死，反而会增加乳酸菌的活性，其特有的保健作用会更大